一、外购商品短缺与毁损增值税进项税额的会计处理方法
　　对于外购商品的短缺与毁损，在未查明原因之前，一般的会计处理方法是：
　　先按外购商品的不含税进价记入“待处理财产损溢”，同时把增值税进项税额通过“应交税金--应交增值税（进项税额转出）”也转入“待处理财产损溢”；然后在查明原因以后再从“待处理财产损溢”把不含税进价和进项税额作相应的会计处理。
　　认为，上述关于外购商品短缺与毁损的会计处理方法过于笼统。因为外购商品的短缺与毁损是由于不同的原因造成的，其增值税进项税额的会计处理也相应地也就应该有所不同。认为，可以按以下方法进行会计处理。首先，在验收入库发现短缺与毁损时，对其增值税进项税额不予以结转，仅对外购商品的不含税进价进行结转：
　　借：待处理财产损溢（不含税进价）
　　贷：商品采购（不含税进价）
　　然后，在查明原因以后，再根据不同情况分别进行会计处理：
　　1、外购商品的短缺或毁损属于运输途中的定额内损耗，其进项税额应予以抵扣，增值税进项税额可以不作处理，只需在审批后记为：
　　借：营业费用（不含税进价）
　　贷：待处理财产损溢（不含税进价）
　　2、若外购商品的短缺与毁损属于途中的超定额内损耗，其进项税额应不予以抵扣，对于该部分进项税额应通过“进项税额转出”转入“营业费用”，记为：
　　借：营业费用（不含税进价+进项税额）
　　贷：待处理财产损溢（不含税进价）
　　　应交税金-应交增值税（进项税额）
　　3、若外购商品的短缺与毁损属于供货单位原因，则需要根据实际情况进行处理：（1）如果对方决定近期内予以补货，则短缺商品的进项税额需要视不同情况处理：若已付款，其进项税额可以抵扣；若未付款，则待付款后方可抵扣。（2）如果对方决定退赔货款，则视不同情况比照进货退出进行处理：若购买方未付款且未做账务处理，应退回原发票，待收到重开的发票后作购进处理；若已付款或已做账务处理，必须取得当地主管税务机关开具的“进货退及索取折让证明单”交给销货方，购买方则应在取得对方开具的红字增值税专用发票后，以红字冲减原已登记的进项税额，记为：
　　借：应收账款（不含税进价+进项税额）
　　　应交税金--应交增值税（进项税额）（红字）
　　　贷：待处理财产损溢（不含税进价）
　　4、外购商品的短缺与毁损属于运输单位造成的，应向运输单位索赔，索赔款中的进项税额应通过“进项税额转出”转入“其他应收款”，记为：
　　借：其他应收款（不含税进价+进项税额转出）
　　贷：应交税金--应交增值税（进项税额转出）
　　　待处理财产损溢（不含税进价）
　　5、如果外购商品的短缺与毁损属于非常损失，其进项税额不得抵扣，而应在批准后通过“进项税额转出”转入“营业外支出”，记为：
　　借：营业外支出（净损失）
　　　材料物资（残料）
　　　其他应收款（保险赔款）
　　贷：待处理财产损溢（不含税进价）
　　应交税金--应交增值税（进项税额转出）
　　二、外购商品短缺与毁损增值税进项税额的会计处理案例分析
　　现举例说明，某商品流通批发企业采用数量进价金额核算从外地甲公司购进A商品1000公斤，增值税专用发票上注明：价款50000元，税额8500元。接到银行转来的托收承付结算凭证及相关凭证，经审核无误，如数以银行存款支付，商品尚未运到，作会计分录如下：
　　借：商品采购--甲公司　　50000
　　　应交税金--应交增值税（进项税额）　　8500
　　贷：银行存款　　58500
　　商品验收入库时，实收980公斤，原因待查，作会计分录如下：
　　借：库存商品　　49000
　　待处理财产损溢　　1000
　　　贷：商品采购　　50000
　　1、若上例商品短缺20公斤，经查明属于定额内损耗，经批准后，作会计分录如下：
　　借：库存商品--A商品　　1000
　　　贷：待处理财产损溢　　1000
　　2、若上例商品短缺20公斤，经查明10公斤属于定额内损耗，另10公斤属于超定额损耗，经批准后，作会计分录如下：
　　借：库存商品--A商品　　500
　　　营业费用　　585
　　贷：待处理财产损溢　　1000
　　　应交税金--应交增值税（进项税额转出）　　85
　　3、若上例商品短缺20公斤，经查明属于对方单位少发，现收到对方单位补发的商品，作会计分录如下：
　　借：库存商品--A商品　　1000
　　贷：待处理财产损溢　　1000
　　4、若上例商品短缺20公斤，经查明属于对方单位少发，经双方协商作退货处理，到主管税务机关开具“证明单”送交供货方，待收到供货方转来的红字增值税专用发票，作会计分录如下：
　　借：应收账款--甲公司　　1170
　　贷：应交税金--应交增值税（进项税额）170（红字）
　　待处理财产损溢　　1000
　　5、若上例商品短缺20公斤，经查明属于运输单位原因，应向运输单位索赔，作会计分录如下：
　　借：其他应收款--运输公司　　1170
　　贷：待处理财产损溢　　1000
　　　应交税金--应交增值税（进项税额转出）　170
　　6、若上例商品短缺20公斤，经查明属于非常损失，收回残料50元，保险公司赔偿500元，进批准后，作如下会计分录：
　　借：材料物资50
　　　其他应收款--保险公司　　500
　　　营业外支出--非常损失　　620
　　贷：待处理财产损溢　　1000
　　应交税金--应交增值税（进项税额转出）　　170