查增的利润如何弥补亏损？关于连锁企业如何纳税第一个是关于查增的利润弥补亏损的问题。
　　假设一企业(非减免税企业)年度终了后45日内未向税务机关申报所得税，此种情况下，税务机关在汇算时查增的利润应如何处理？一种观点是，根据国税发［1997］191号文规定，应先按法定税率33％补缴税款，同时还可予以处罚，查增的利润可以用于弥补当年亏损，但不得弥补以前年度亏损。另一种观点是，根据国税发［1996］162号及国税［1996］653号文规定，查增的利润应允予弥补当年亏损，弥补后有盈余的就盈余的利润征收所得税，无盈余则不征税。但，可将查增的利润应纳所得税作为处罚的依据，其理由是虽有［1997］191号文，但未宣布162号及653号文废止。不知两种观点哪种正确？或者有无其他文件规定。
　　另外，税务机关是否每年都应通知企业进行所得税申报和相关纳税调整？若未通知，企业能否以此作为拒绝接受处罚的理由？
　　第二个是关于连锁企业纳税的问题，市场经济条件下，企业进货渠道不同、进货规模大小都能左右进货价格，且差异很大，如何判断连锁企业是否违反《征管法》第36条及《细则》第54条，特别是在无同等规模的企业可比情况下，能否确定一个上下浮动比例？
　　答：关于查增利润弥补亏损的问题，以上提到了3个文件，因此，首先要明确3个文件的内容及区别。162号文和653号文是对“亏损”企业进行税务检查后有新增利润，确认“企业虚报亏损”的税务处理。191号文是对未亏损的企业税务检查后有新增利润的税务处理。两者侧重点不同。其次是税务处理：
　　1．对“亏损”企业进行税务检查后有新增利润，确认“企业虚报亏损”的税务处理。根据653号文，如果检查调整后企业仍然亏损，只处罚，不补税；如果检查调整后企业不亏损，既要处罚，又要补税。要注意的是根据新颁布的《征管法》，对检查调整后企业仍然亏损的，不作为偷税，按《征管法》第六十四条进行处罚，不再按653号文的处罚规定进行处罚；同样，对检查调整后企业不亏损的处罚应作为偷税处理，按《征管法》第六十三条进行处罚。
　　2．对未亏损的企业税务检查后有新增利润的税务处理。根据191号文规定，对纳税人查增的所得额，应先按适用税率补税，再按《征管法》第六十三条进行处罚。
　　按《企业所得税暂行条例》及《实施细则》纳税人应自行进行纳税调整和纳税申报。纳税人未自行申报和进行纳税调整的，税务机关检查后将按《征管法》有关规定进行补税和处罚。税务机关不必通知纳税人进行所得税申报和纳税调整。
　　关于连锁企业纳税问题，我们以为应该慎重。你提出对连锁企业进货价格进行调整，是基于《征管法》规定对关联价格可以进行调整。但这首先要认定连锁企业和供货商之间(而不是连锁企业之间)是否是关联企业，当连锁企业与供货商之间没有人员、资本、管理关系时，按现在征管实践中的做法，就必须判定“企业的产品或商品的销售是由另一企业所控制的”，才能认定其价格是关联价格。此后，还要判定该关联价格是否合理、正常，当然新《征管法》要求由纳税人提供有关价格、费用等资料举证证明其转让定价的合理性(具体办法未定)。不经过这些程序，而通过规定价格的浮动比例来“一刀切”认定企业之间是否有关联关系、关联价格是否合理，我个人以为不太可取。不能仅仅依据连锁企业进货规模大、进货价格低，就简单得出结论。关键是看供货商与连锁企业是否按独立企业关系在进行交易，进货价格又低到什么程度。我想，他们如果没什么特殊关系的话，就算连锁企业规模再大，让供货商贴本卖还是不太可能的。