企业按照《中华人民共和国企业会计制度》和16项具体会计准则的规定进行会计核算，如果当年账面利润为负数，即为会计上讲的“亏损”。
　　企业在当年发生亏损的情况下，与实现利润的情况相同，应当将本年发生的亏损自“本年利润”科目，转入“利润分配——未分配利润”科目，借记“利润分配——未分配利润”科目，贷记“本年利润”科目，结转后“利润分配”科目的借方余额，即为未弥补亏损的数额。然后通过“利润分配”科目核算有关亏损的弥补情况。
　　企业发生的亏损可以以次年实现的税前利润弥补。在以次年实现的税前利润弥补以前年度亏损的情况下，企业当年实现的利润自“本年利润”科目，转入“利润分配——未分配利润”科目，将本年实现的利润结转到“利润分配——未分配利润”科目的贷方，其贷方发生额与“利润分配——未分配利润”的借方余额自然抵补。因此，以当年实现净利润弥补以前年度结转的未弥补亏损时，不需要进行专门的账务处理。
　　由于未弥补亏损形成的时间长短不同等原因，以前年度未弥补亏损有的可以以当年实现的税前利润弥补，有的则须用税后利润弥补。无论是以税前利润还是以税后利润弥补亏损，其会计处理方法相同，无需专门作会计分录。但如果用盈余公积弥补亏损，则需作账务处理，借记“盈余公积”科目，贷记“未分配利润——盈余公积补亏”科目。
　　企业在实际操作中，应注意下列问题：
　　1、税务机关对纳税人查增的所得额，不得用于弥补以前年度亏损。
　　2、对外投资分回利润弥补亏损的方法。
　　国税发（1994）250号文件规定，纳税人在国内投资、联营取得利润，如果投资方企业发生亏损，其分回的利润可先弥补亏损，弥补亏损后仍有余额的，再按照规定补缴所得税。为了简化计算，企业发生亏损，对其从被投资方分回的投资收益（包括股息、红利、联营分利等）允许不再还原为税前利润，而直接用于弥补亏损，剩余部分再按规定计算补税。如果企业既有按规定需要补税的投资收益，也有不需要补税的投资收益，可先用需要补税的投资收益直接弥补亏损，弥补后还有亏损的，再用不需要补税的投资收益弥补亏损，弥补后有盈余的，不再补税。
　　3、免税所得的弥补
　　按照税法规定，企业的某些项目免征所得税。如果一个企业既有应税项目，又有免税项目，其应税项目发生亏损时，按照税收法规规定可以结转以后年度弥补的亏损，应该是冲抵免税项目所得后的余额。此外，虽然应税项目有所得，但不足弥补以前年度亏损，免税项目所得可用于弥补亏损。
　　如某内资企业2004年应税项目亏损15万，免税项目所得10万元；2005年应税项目所得4万，免税项目所得8万元
　　则：2004年：不纳税，15－10＝5万亏损结转下年
　　2005年：不纳税，没有未弥补亏损
　　4、弥补亏损后有所得的适用税率确定方法。
　　国税发（1994）132号文件规定，企业上一年度发生亏损，可用当年所得予以弥补，按弥补亏损后的所得额来确定适用税率。
　　弥补亏损是一项重要的税收政策，税务机关和纳税人均应当建立亏损弥补备查台账，为今后准确核定或申报弥补亏损奠定坚实的基础。
　　5、盈余公积弥补亏损
企业发生的亏损，在由董事会提议并经股东大会或类似机构决议批准后，可以用企业提取的法定盈余公积、任意盈余公积弥补。由于企业未弥补的亏损表现为“利润分配—未分配利润”科目借方余额，因此用盈余公积弥补亏损时，应先将用于弥补亏损的盈余公积转入“利润分配—其他转入”科目，再通过利润分配科目弥补亏损。
　　企业经股东大会或类似机构决议，用盈
　　余公积弥补亏损时，应借记“盈余公积—法定盈余公积或任意盈余公积”科目，贷记“利润分配—其他转入”科目。
　　例：长江股份有限公司20×2年2月15日经股东大会决议，用法定盈余公积600000元，任意盈余公积400000元，弥补企业亏损。应作如下会计分录：
　　借：盈余公积—法定盈余公积   600000
　　　　　　　　—任意盈余公积   400000
　　　　贷：利润分配—其他转入　　　　1000000