新企业所得税法不仅实现了并行多年的内、外资企业所得税制度的统一，也在此基础上根据新的经济形势的变化，对企业所得税制度进行了完善和补充，进行了新的制度构建。从总体上说，新企业所得税法实现了以下八项制度创新：
　　一、确立了以法人为标准的纳税主体制度，引入居民、非居民的概念　
　　（一）统一了适用对象，确立了无差别的纳税主体制度
　　新企业所得税法关于纳税人的界定，改变了以资本的来源作为区分标准的做法，而是规定在中华人民共和国境内的企业和其他取得收入的组织为企业所得税的纳税人。由此，新企业所得税法统一了适用对象，确立了无差别的纳税主体制度。所有的纳税人，无论其资金来源、经济属性、规模、所属区域．均应根据其经济收益能力，平等地承担纳税义务、享受税法的保护，从而实现税收负担的平等分配。
　　（二）确立了以法人为标准的纳税主体制度
　　1．新企业所得税法关于纳税人的界定，改变了以往内资企业所得税以独立核算的三个条件来判定纳税人标准的做法，只要是我国境内的企业和其他取得收入的组织，均作为企业所得税的纳税人。
　　2．新企业所得税法以法律形式明确排除了个人独资企业和合伙企业的企业所得税纳税义务。一方面，虽然这两类企业也从事生产经营活动，但企业不拥有独立财产，无法准确衡量其税收负担能力:另一方面，这两类企业经营规模一般较小，如同时征收企业所得税和个人所得税，则存在双重征税，会加重其经济负担。因此个人独资企业和合伙企业不适用新企业所得税法，不仅在法理上具有合理依据，也与我国有关立法相统一，符合国际立法惯例。
　　此外，将非法人的个人独资企业和合伙企业排除在企业所得税的纳税人之外，也体现了我国在企业所得税纳税主体标准上的选择。以法律形式对组织进行区分，主要可分为法人和非法人。目前我国存在着多种形式的企业，并且取得收入的组织也形式各异，并不都具有法人资格。虽然税法并没有强调纳税人的法人地位，但实行法人所得税制是国际通行做法，有利于更加规范、科学、合理地确定纳税义务。同时在非法人企业中，一部分属于历史遗留问题，如全民所有制企业和集体所有制企业：一部分是改革开放初期为吸引和方便外商投资而采用的灵活多样的企业形式和投资方式还有一部分则属于常设机构，但即使是常设机构纳税，真正的主体仍然是外国企业，主要还是法人。新企业所得税法关于“居民企业在中国境内设立不具有法人资格营业机构的，应当汇总计算、缴纳企业所得税”的规定，也暗含了对法人标准的偏好。因此．随着市场主体立法的健全和公司治理结构的完善，以法人作为企业所得税纳税主体将成为税法进
一步完善的方向。
　　（三）采用类似《个人所得税法》对纳税人的分类方式，将企业划分为居民企业和非居民企业　新企业所得税法第二条规定，依法在中国境内成立，或者依照外国（地区）法律成立但实际管理机构在中国境内的企业为居民企业；依照外国（地区）法律成立且实际管理机构不在中国境内，但在中国境内设立机构、场所的，或者在中国境内未设立机构、场所，但有来源于中国境内所得的企业为非居民企业。此规定借鉴了国际通行做法，突破了长期以来我国企业所得税的规范囿于经济所有制性质或资本来源性质的不合理框架。
　　对纳税人以居民标准进行区分。无论从实质的经济联系，还是法律联系来看，对一国的税收收入和国家主权都具有重要意义。但我国以往只在《个人所得税法》中采纳国际惯例，采用住所和居住时间两个标准将自然人纳税人分为居民和非居民；而在企业所得税领域，很长一段时间是依照经济所有制性质，或以资本来源性质（内、外资）区分纳税人。虽然《中华人民共和国外商投资企业和外国企业所得税法》中区分了外商投资企业与外国企业不同的纳税义务，但实质是按照属人和属地税收管辖权对居民纳税人和非居民纳税人的不同纳税义务进行的区分。此次新企业所得税法首次在企业所得税领域明确了“居民企业”、“非居民企业”的概念与区分，体现了与国际惯例的衔接，也与过去的立法相协调。
　　从立法表述看，新企业所得税法结合我国的实际情况，采用了“登记注册地标准”和“实际管理机构所在地标准”相结合的办法认定居民企业，不仅较好地解决了居民企业的认定问题，而且比较灵活，符合我国经济发展的实际情况，有利于我国税收管辖权的行使。
　　二、确立了具有国际竞争力的税率制度
　　所得税主要有两方面的功能：一是财政功能，通过征收所得税为国家提供稳定可靠的财政收入来源；二是调节功能，通过所得税结构的合理设计和安排，贯彻国家经济政策和社会政策。而税率作为直接涉及纳税人税负和国家财政收入的因素，则成为所得税发挥作用的主要手段。税率的确定应当考虑保护人民基本财产权、人民经济活动的自由和人格发展的自由。侵犯人民基本权利和自由的税率不符合现代治国理念。在考虑企业的实际税负、周边国家的税率、财政负担能力以及外资的心理承受能力等因素的基础上，新企业所得税法规定税率为25％，并规定符合条件的小型微利企业减按20％的税率征收企业所得税，国家需要重点扶持的高新技术企业减按15％的税率征收企业所得税。
　　从税率形式上看，25％的比例税率在一定程度上兼顾了公平和效率的要求，可以保证各类企业享有平等的竞争环境，从而促使企业提高效率。简明的税率也便利了征管，弥补了现行企业所得税制度的不合理和不科学之处。
　　从税率水平上看，25％的税率较33％降低了8个百分点，不仅从国内企业和财政的角度考虑比较适宜，也符合世界性减税的潮流。首先，从税制改革的趋势看，20世纪80年代中期开始的世界性税制改革的重要内容是公司（企业）所得税的税率下调。2005年全球43个国家的综合税率为29.49％。比较主要发达国家和我国周边国家企业所得税的基准税率，目前美、法、德、英、意等主要发达国家的企业所得税基准税率分别为35％、33.33％、25％、30％、33％。而周边国家如日本、韩国、越南、印尼、马来西亚则分别为30％、27.5％、28％、30％、28％。因此，25％的税率在保证我国企业国际竞争力的同时，也充分考虑了国际税率水平，仍具有对外资的吸引力。其次，从企业所得税的财政职能看，不存在束缚进行税法改革的财政压力。虽然税率降低对财政收入的影响是显著的，但由于内资企业的税基会有较高速度的增加，内资企业所得税收入的减少将与外资企业所得税收入的增加大体相当；并且，近年我国财政收入每年都以较大的幅度增长，国家完全可以承受统一的25％的企业所得税税率改革带来的财政压力。对企业而言，税率的降低有助于刺激投资、扩大再生产，同时，低税率还有利于鼓励企业诚信纳税，减轻征管成本。第三．从企业所得税的调节功能看，降低税率，改变税率过高、复杂的税收优惠的情况，有利于不同类型的企业在一个平等的起点进行竞争。
　　三、确立了科学规范的征税客体制度
　　所得税是对纯所得课征的租税。收入的多少不能完全反映纳税人纳税能力的大小，只有对纯所得课征才能够实现量能课税，体现公平。确定应税所得是所得税法的重要内容。新企业所得税法明确规定了企业的应纳税所得额，即企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额。
　　新企业所得税法首次提出了不征税收入的概念，并规定了何为免税收入。不征税收入，从性质和根源上是不属于企业营利性活动带来的经济利益，不负有纳税义务，永久不列为征税范围；而免税收入是属于政府根据经济政策目标的需要，在一定时间免予征税，而在一定时期又可能恢复征税的收入，属于税收优惠。从理论上看，国家与纳税人之间已成立税收之债，免税属于纳税义务的消灭，“对法定应纳税额不予征收”，是国家单方消灭其与纳税人之间的债权债务关系。新企业所得税法对两者进行了准确的界定，纠正了长期执法实践中两者的混淆。
　　同时，企业所得税税前成本费用等支出的扣除办法和标准，直接影响企业的实际税负，直接关系到企业所得税的税基。现行内、外资企业所得税税前扣除办法和标准的差异，是造成内、外资企业实际税负差异的重要原因。新企业所得税法对税前扣除标准进行了统一和规范，如第八条规定，企业实际发生的与经营活动有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，可以在计算应纳税税额时进行扣除。这样的规定有利于企业生产经营过程中发生的成本费用的扣除，有利于以“净所得”实际衡量企业的税收负担能力，真正实现税收公平。
　　新企业所得税法对税前扣除标准的统一，体现了立法的科学和公平。对内资企业而言，降低了税收负担，实现了公平竞争，有利于企业发展；对外资企业而言，虽然其税收负担略有增加，但其费用扣除范围也在一定程度上扩大了，如将允许税前扣除的企业研发费用由实际发生额的50％提高至按实际发生额的150％，有利于外资企业参与高新技术的研发，提升其科技竞争力。
　　四、建立了国际化的税收抵免制度
　　法律性双重征税，是指两个（或两个以上）国家对同一纳税人的同一所得进行征税。随着经济全球化和跨国投资的发展，基于本国的税收管辖权，投资国与投资者母国均有权对跨国投资所得征税。跨国所得的重复征税造成的负面影响是明显的。一方面，纳税人要承担两个国家的税收负担，增加了其跨国贸易、投资的成本和不确定性；另一方面，国家虽然可能在短期内增加了税收收入，但长远看，重复征税必然导致跨国投资的减少，从而减少税源．削弱国家的经济实力，不利于经济发展和财政收入增加。因此，避免法律性双重征税，为货物、资本、劳务跨国自由流动铲除税收障碍，促进跨国贸易和投资的发展，已成为世界各国的共识。
　　避免法律性双重征税主要有两大方式：一是双边方式，即国家间通过签订税收协定，协调税收管辖权．避免双重征税。但税收协定并不能穷尽所有可能的避免双重征税方式。二是单边方式，一些国家在本国税法中规定了避免双重征税的方法，增强制度的可操作性，作为对税收协定的补充。
　　为更好地消除国际性双重征税，新企业所得税法第二十三条、第二十四条规定了境外所得的税收抵免制度，对我国居民企业来源于中国境外的应税所得和非居民企业在中国境内设立机构场所取得发生在中国境外但与该机构场所有实际联系的 应税所得已在境外缴纳的所得税税额，可以从其当期应纳税额中抵免；对居民企业从其直接或者间接控制的外国企业分得的来源于中国境外的股息、红利等权益性投资收益，外国企业在境外实际缴纳的所得税税额中属于该项所得负担的部分，可以作为该居民企业的可抵免境外所得税税额，在规定的抵免限额内抵免。
　　我国规定的税收抵免制度为限额抵免，即允许企业或常设机构抵免的税额不得超过根据新企业所得税法计算出来的应纳税额，体现了公平课税的原则。同时，新企业所得税法继续沿用分国不分项的抵免方法。
　　五、建立了以产业导向为主的普适性税收优惠制度
　　税收优惠，是对部分特定纳税人和征税对象给予税收上的鼓励和照顾，是财政政策的重要手段。政府通过税收优惠能够引导企业从事国家鼓励发展的产业，鼓励和引导社会投资，从而增加就业、优化经济结构和资源配置、调节收入分配、促进经济发展，最终实现国家的宏观经济目标，实现经济社会的整体协调发展。针对现行企业所得税优惠政策不统一、内容不合理、重点不突出的问题，新企业所得税法特设“税收优惠”一章，从四个方面对税收优惠政策进行重新整合和完善，建立了以产业优惠为主、区域优惠为辅的税收优惠制度：1．保留原有的税收优惠措施，如第二十七条、第二十八条；2．扩大原有税收优惠的范围，如第三十一条、第三十四条；3．改变税收优惠的具体措施，如第三十条、第三十二条、第三十三条4取消原有的税收优惠政策，如取消对新设立和过渡期结束后的生产性外资企业的定期减免税优惠政策以及产品主要出口的外资企业减半征税的优惠政策等。
　　同时，为改变有关部门、地方政府出于吸引资金或地方保护主义考虑而制定行业性、地区性税收优惠政策的状况，新企业所得税法将税收优惠的制定权集中于中央，仅赋予民族自治地方有限的税收优惠政策的调整权，实现了税收优惠的规范和统一。
　　在保持政策稳定性和连续性的基础上，通过整合和完善，新的税收优惠政策的产业导向更为明确，重点更为突出，更有利于促进技术创新和科技进步、推动产业升级、实现国民经济的可持续发展。
　　六、建立了体系化和规范化的反避税制度
　　反避税工作是税务管理的重要内容，也是各国维护国家税收主权和税收利益的主要手段。随着我国对外开放日益深入和扩大，一方面，部分跨国企业往往利用境内外税制差异和境内地区间税收优惠的差异等，通过企业集团内部关联交易的转让定价、资本弱化等方式将利润转移到国外，造成我国税收流失；另一方面，内资企业避税现象也在逐渐增多。
　　为了防范各种避税行为，新企业所得税法特设“特别纳税调整”一章，主要包括以下内容：一是引入“独立交易原则”作为转让定价税制的核心原则。要求关联方之间的交易应当符合独立方在类似情况下从事类似交易时可能建立的商业和财务关系。几乎所有引入转让定价税制的国家都在立法中明确独立交易原则，表明转让定价的判断和调整必须符合该原则。二是明确纳税人提供相关资料的义务。纳税人应在关联交易发生的同时准备证明其符合独立交易原则的资料，在税务机关调查时应承担协力义务并证明其关联交易的合理性。三是借鉴反避税的国际立法经验。结合我国反避税实践，新企业所得税法借鉴国际经验，适时补充了对资本弱化、利用避税地避税等具体避税行为的防范措施，强化了企业所得税征管，切实维护国家税收权益。
　　在立法体例上，我国采取个别性反避税条款和一般性反避税条款并立模式。个别性条款便于重点打击、合理防范，但涵盖面窄、有滞后性，存在法律漏洞，易为避税者所利甩一般性条款可以避免因不能在短期内制定出大量详密的个别性反避税条款带来的问题，还可以有效防止税务机关自由裁量权的滥用。这种概括式与列举式结合的立法模式，基本涵盖了目前对各种避税行为进行规制的方法，比如转让定价、预约定价、反资本弱化、反避税地避税等。
　　在反避税程序上，新企业所得税法增加了有关的核定程序、预约定价安排、补征税款、加收利息等条款以及企业所承担的提供纳税资料和关联业务往来报告等协力义务，从而有效地强化了反避税措施，使反避税规范体系化，有利于防范和制止避税行为，维护国家利益。
　　七、建立了统一的企业所得税税收征管制度
　　企业所得税的征管是纳税主体与征税主体权利实现与义务履行的程序保障。企业所得税法在保证法律稳定性、连续性的同时，针对企业所得税征管特点，既注重内资企业与外资企业在法律适用上的一致性，又重视法律条文的简洁性、明确性、实用性、涵盖性，不仅体现了立法技术的进步，而且将法律变动的灵活性与法律实施的具体情况结合起来，有利于法律的施行。
　　在现行企业所得税制度中，内、外资企业的纳税地点存在较大差异。新企业所得税法首先明确了居民企业的纳税地点为企业登记注册地，如登记注册地在境外的，则以实际管理机构所在地为纳税地点；对非居民企业取得新企业所得税法第三条第二款规定的所得的，则以机构、场所所在地为纳税地点；非居民企业取得新企业所得税法第三条第三款规定的所得，以扣缴义务人所在地为纳税地点；非居民企业在中国境内设立两个或两个以上机构、场所的，经税务机关审核批准，可以选择由其主要机构、场所汇总缴纳企业所得税；对居民企业在中国境内设立不具有法人资格营业机构的，应当汇总计算、缴纳企业所得税，以居民企业的登记注册地为纳税地点。对于合并纳税．新企业所得税法原则上持否定态度。新企业所得税法第五十二条规定，除国务院另有规定外，企业之间不得合并缴纳企业所得税。这主要是因为企业之间合并缴纳企业所得税存在诸多弊端。首先，集团内所有公司必须使用相同的纳税年度．并且选择合并纳税方式后就很难在以后年度更改。其次，合并纳税在一定程度上会影响国家的税收收入，也容易促使企业有意识地进行税收筹划，逃避国家税收。第三，由于合并纳税在技术处理上比较复杂，需要辅之以先进的监控、审核手段，有可能会增加征管成本。
　　除此以外，新企业所得税法对纳税年度的起算时间、纳税方式以及企业终止经营活动后的汇算清缴等也做出了明确的规定。
　　八、建立了本土化的企业信赖利益保护制度
　　信赖保护原则是德国行政法的基本原则。信赖利益保护在税法上应得到承认和实施，即应在适当的范围内保护纳税人的信赖利益。在税收征收实践中，纳税人基于善意的动机有理由相信税务机关所为的某些行为会产生相应的法律后果；据此，纳税人实施了相应的行为，在此情况下，尽管事实上纳税人的行为与税务机关的要求不符，但是，基于纳税人的主观善意仍然得承认其据此所获得相应利益。
　　新企业所得税法对内、外资企业的税负均有重大影响，尤其是对享有税收优惠的企业。因此，对外资的税收优惠必须实行“老企业老办法，新企业新办法”。为实现新、旧企业所得税制度的衔接，保持现行企业所得税优惠政策的连续性，新企业所得税法第五十七条规定，对企业所得税法公布前已经批准设立的企业，依照当时的税收法律、行政法规规定，享受低税率优惠的，可以在新企业所得税法施行后5年内，逐步过渡到新企业所得税法规定的税率；享受定期减免税优惠的．可以在新企业所得税法施行后继续享受到期满为止，但因未获利而尚未享受优惠的，优惠期限从新企业所得税法施行年度起计算；法律设置的发展对外经济合作和技术交流的特定地区内，以及国务院已规定执行地区特殊政策的地区内新设立的国家需要重点扶持的高新技术企业，可以享受过渡性税收优惠；国家已确定的其他鼓励类企业，可以按照国务院规定享受减免税优惠。
　　法不溯及既往是法治的基本原则，也是WTO的基本原则。税法禁止溯及既往是针对税法实施前的交易和行为，而不是税法施行之前取得市场主体资格的纳税人。诚如日本学者金子宏的观点：“就过去的事实和交易所产生的纳税义务这一内容，对纳税人有利的变更，其溯及立法是被承认的。但是，对纳税人不利的变更，其溯及立法原则上是不允许的”。因此，纳税人按照新企业所得税法执行，并不是溯及企业既往的交易和行为，也不是对法律实施前的交易行为产生的所得按照新企业所得税法征税，并没有违反税法的禁止溯及既往原则。新企业所得税法第五十七条第一款的过渡性政策只是税率和减免税的过渡，企业所得税的成本、费用以及应纳税所得额的核算，还是依据新规定执行。过渡期的规定是防止原享有税收优惠的企业的实际税负水平在新企业所得税法实施后大幅度增加的必然要求，有利于给外资企业以缓冲期，减轻“两法合并”对外资企业所造成的冲击，在一定程度上实现税法的稳定，保护企业的信赖利益。
　　企业所得税法律制度改革作为我国财税法律制度完善的重要环节，一方面，体现了我国既有的积极稳妥的渐进式改革方案，而这种渐进式改革是符合我国国情的，且有利于政策的连续性，保证新机制的平稳确立，实现“积极改革、平稳转换”的目的：另一方面，在渐进式的税制改革方式下，新企业所得税法在若干重要的制度方面实现了突破和国际接轨，不仅有利于推进企业所得税制度的完善和平等竞争的税收法治环境的形成，还将对我国产业结构调整和区域经济均衡发展起到促进作用。同时，新企业所得税法的立法本身也为我国财税立法的改革提供了可供借鉴的模式，其制度创新的影响是深远的。